식물 검역 등록증 제도는 각급 식물 검역기관이 국가 식물 검역법에 따라 종자, 묘목 등 번식재와 국가 규정에 따라 검역을 해야 하는 기타 식물, 식물제품의 단위 또는 개인을 등록하는 관리제도다. 식물 검역 기관의 등록은 적극적으로 방어 검역을 조직하고, 표적 검역법제 홍보를 실시하고, 상대인 검역법제 의식을 높이는 중요한 방법이다. 분류 관리, 정기 또는 비정기 샘플링, 검역 검사, 전염병 모니터링, 방역지도는 상대인의 위법 행위를 효과적으로 방지하고, 운송된 식물과 식물제품이 검역성 유해생물을 휴대하고, 제때에 예방조치를 조직할 수 있는지 여부를 제때에 발견할 수 있다.