(2) 샘플
(3) iTRAQ/TMT 프로젝트 설계
체외 동량 이위 동위원소 표기의 정량 기술은 여러 샘플 (보통 10 개 미만) 간의 단백질 표현의 차이를 동시에 비교할 수 있다.
기본 원칙:
(4) 태그 없는 프로젝트 설계
Labelfree 는 플루토늄 이온 스펙트럼의 최고봉 강도를 비교하여 다양한 소스 샘플에서 단백질 표현의 차이를 분석한다. 이런 기술은 비싼 동위원소 표시를 내표로 사용할 필요가 없다.
기본 원칙:
(5) 디아 프로젝트 설계
DIA 는 데이터 독립적 정량 수집 기술로, 질량 스펙트럼의 전체 스캔 범위를 여러 창으로 나누어 각 창에서 모든 이온을 고속으로 선택, 조각 및 감지하여 샘플 내 모든 이온의 모든 조각 정보를 누락 없이 얻을 수 있습니다. DIA 는 대상 펩타이드 세그먼트를 지정할 필요가 없으며 스캔 포인트는 짝수입니다. 스펙트럼 라이브러리를 사용하면 질적 확인과 정량 이온 필터링, 데이터 역추적 등을 수행할 수 있습니다.
기본 원칙:
(6) 다양한 정량 기술의 비교
데이터 수집 방식에서는 iTRAQ/TMT 와 Labelfree 가 전통적인 DDA 스캔입니다. 즉, 각 스캔 주기 동안 가장 풍부한 10-20 모이온 신호의 하위 이온 조각만 수집되고, 다른 신호의 하위 이온 정보는 손실되고 적용 범위는 낮고 무작위성은 높습니다. DIA 스캔은 각 스캔 주기 동안 품질 간격을 여러 개의 창 세그먼트로 설정하고 각 창에서 모이온 및 해당 조각에 대한 모든 정보를 수집합니다 (스캔 속도가 충분히 빠름). 따라서 적용 범위가 높고 반복성이 높습니다.
(7) 데이터베이스 소프트웨어 검색
(1) 크로마토 그래피 품질 관리
Proteomics 연구는 다음과 같은 관점에서 분석 될 수 있습니다:
(2) 기능 수준