푸젠성 기업연합회 사무국에 종합서비스부, 사무실, 회원근무부, 연락근무부 (고용주근무부), 협회근무부, 연구부, 교육평가인증부 등 7 개 부서가 설치됐다. 한편 푸젠성 기업연합회는 과학기술진보촉진위원회, 인적자원서비스위원회, 기업대외협력서비스위원회, 기업위권업무위원회, 정책자문서비스위원회 등 9 개 전문서비스위원회를 설립했다. 푸젠성 기업연합회는 국가공신부가 인정한 전국 중소기업 공공서비스 시범플랫폼, 푸젠성 중소기업 공공서비스 시범플랫폼, 푸젠성 중소기업 창구 서비스 플랫폼을 건립해 성 내 기업과 경제협회에 과학기술진보, 인적자원, 기업권권, 정책상담, 정보화, 금융 등 다단계, 고퀄리티 서비스를 제공했다.