구글 홈페이지를 열고, VecScreen 을 검색하고, VecScreen 홈페이지로 이동하고, 시퀀스를 복사하고, 실행하고, 보고서를 봅니다.
둘째, 결과:
출력 시퀀스 길이는 9 18bp 입니다.
캐리어 시퀀스의 영역은 456 BP-854 BP 입니다.
클론 캐리어: M 13mp 18 파지, pGEM- 13Zf(+), pBR322, pRKW2.
2. 해당 도구를 사용하여 알 수 없는 후속 시퀀스의 반복 시퀀스를 분석하고 반복 시퀀스의 영역, 모든 반복 시퀀스의 유형, 반복 시퀀스의 총 길이 및 차폐 시퀀스를 출력합니다.
먼저 다음 단계를 수행합니다.
구글 홈페이지, ICBI 홈페이지, 폭발순서. 순서는 인간의 것이다.
구글 홈 페이지, RepeatMasker 검색, RepeatMasker 홈 페이지 입력, RepeatMasking 입력, 시퀀스 복제, DNA 소스에서 인간 선택, 실행! 하이퍼링크를 클릭하고 결과에서 선택합니다.
주석 파일: rm2 sequepload _1287631711.out.html
3. CpGPlot/CpGReport/Isochore 도구를 사용하여 다음과 같은 알 수 없는 시퀀스를 분석하고 CpG 섬의 길이, 면적, GC 수, 퍼센트 및 Obs/Exp 값을 출력합니다. 먼저 다음 단계를 수행합니다.
구글 홈페이지로 들어가, CpGPlot 을 검색하고, CpGPlot 홈페이지로 이동하고, 프로그램에서 cpgreport 복제 시퀀스를 선택하고, 실행!
둘째, 결과:
CpG 아일랜드 길이: 385bp.
지역: 48-432;
GC 수량: 합계 C+G=297, 퍼센트 =77. 14.
Obs/Exp: 1.0 1
4. 다음 시퀀스의 서브모터를 예측하고 가능한 서브시퀀스와 해당 위치를 출력합니다. 먼저 다음 단계를 수행합니다.
구글 홈페이지, ICBI 홈페이지, 폭발순서. 순서는 인간의 것이다.
Google 홈 페이지로 이동, 검색 신경망 프로모터 예측, 홈 페이지로 이동, 시퀀스 복사, 진핵 생물 선택, 실행!
둘째, 결과:
위치: 711-761,1388-1438,/
5. 스플 라이스 사이트 예측 도구를 사용하여 아래 시퀀스를 분석하고, 각각 인트론-엑손 스플 라이스 사이트의 기증자 및 수용체 영역과 스플 라이스 사이트의 염기를 출력합니다. 먼저 다음 단계를 수행합니다.
구글 홈페이지, ICBI 홈페이지, 폭발순서. 순서는 인간의 것이다.
구글 홈페이지에 가서 오려내기 사이트 예측 검색, 홈페이지로 이동, 시퀀스 복사. 조직은 인간이나 다른 것을 선택합니다. 기타 기본값, 실행!
둘째, 결과:
기부자:
수용체:
6. 아래 시퀀스에 대해 6 상자 번역을 수행하고, GENESCAN 을 통해 어느 ORF 가 옳은지 종합적으로 분석하고 (먼저 주어진 시퀀스의 종 출처를 결정), 6 상자 번역 (스크린 샷) 및 GENESCAN 결과 (예측된 유전자/엑손 및 예측된 펩타이드 시퀀스 포함) 를 출력합니다. 먼저 다음 단계를 수행합니다.
구글 홈페이지, ICBI 홈페이지, 폭발순서. 시퀀스는 Zea 입니다.
구글 홈페이지로 갑니다. NCBI 검색, 홈 페이지로 이동, 모든 리소스 선택 (A~Z), O, Orfpinder 를 선택합니다. 시퀀스 복사, 기본값, 실행!
결과: ORF 차트
3 단계: 구글 홈페이지로 들어가, GENESCAN 을 검색하고, 홈페이지로 들어가고, 조직: 크기 등 기본값, 실행!
넷째, 결과:
G7. REBASE 제한 내체효소 데이터베이스에 들어가 AluI, MboI, EcoI 의 세 가지 내체효소의 인식 순서와 유형을 출력합니다.
1. 단계: 구글 홈 페이지, 영어 구글, 검색 REBASE, 홈 페이지, AluI, MboI, EcoI, 실행 입력!
MboI 에서 첫 번째를 선택하고 EcoI 에서 두 번째를 선택합니다.
둘째, 결과:
엔스칸투
8. 유인물 설계 도구를 사용하여 다음과 같은 알 수 없는 시퀀스에 대해 한 쌍의 유인물을 설계합니다. 필요한 유인물 길이는 20-25bp, 증강산물 길이는 300-500bp, 어닐링 온도는 50-60 C 입니다. 선택한 프라이머 쌍 (정방향 프라이머 및 역방향 프라이머) 과 해당 GC 함량, 프라이머 사이트, Tm 값 및 제품 길이를 적어주십시오. 1. 단계: 구글 홈 페이지 입력, genefisher 검색, 홈 페이지 입력, fasta 형식 복사, chechk input, sunmit; 을 눌러 섹션을 인쇄할 수도 있습니다 유인물 길이를 20-25bp 로 설정하고, 증강산물 길이를 300-500bp 로 설정하고, 어닐링 온도를 50-60 C 로 설정합니다. 。
둘째, 결과:
GC 함량:
프라이머 위치:
Tm 값:
제품 길이:.
9. NEBcutter 2.0 도구를 사용하여 아래 시퀀스를 분석하고, 평평한 끝과 네 개의 절단 부위의 효소로 잘라서 스냅샷이 있는 view gel 에 제출합니다. 진지당 1.4% 와 100bp DNA 사다리가 필요합니다.
먼저 다음 단계를 수행합니다.
구글 홈페이지, ICBI 홈페이지, 폭발 서열, 선형인 줄 알았어요.
구글 홈페이지로 들어가, NEBcutter 2.0 을 검색하고, 홈페이지로 들어가, 선형, 실행을 선택하세요! 사용자 지정 요약을 선택하고 "1" 를 "4" 로 변경하고 편평한 끝을 선택한 다음 요약을 선택합니다. 젤 보기. 1.4% 아가로 설탕을 선택하고 100bp 로 표시합니다.
둘째, 결과:
그리고 단백질입니다. 일반적으로 swiss-prot 는 이론적인 분자량을 찾기 위해 pi/mw 계산을 검색하는 데 적합합니다. Protparam 물리적 및 화학적 성질. 프로테아제와 화학 시약 처리에 사용되는 내체 단백질 효소의 친수와 소수성 플루토늄의 품질 분석.
NCBI-GenBank 데이터베이스
데이터베이스 유사성 검색-핵산 서열과 핵산 데이터베이스 (BLASTN) 비교
단백질 서열과 데이터베이스의 단백질 서열 비교 (BLASTP)
두 시퀀스를 정렬합니다.
DNA 서열 분석-오펜드 (www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)
분석 실험 시퀀스의 엑손 -genscan (/nebcuter2/index.php)
참고: 사용자 지정 요약-젤 보기
제한적 내체효소 데이터베이스 -rebase (/rebase/rebase.html)
프라이머 증폭 설계-유전자 피셔의 실험 서열
프라이머 3
단백질 서열 분석 및 구조 예측;
1. 단백질의 분자량 및 등전점 예측: ExPASy (pI/Mw 계산).
단백질의 기본 물리 화학적 성질 분석: ExPASy(ProtParam).
3. 단백질의 친수성과 소수성 분석: ExPASy(ProtScale).
4. 단백질이 각종 단백질 효소와 화학 시약 처리를 거친 내체효소 산물 분석: EXPASY (펩타이드 품질) [*: 키나아제 K].
단백질 신호 펩타이드 분석: ExPASy(SignalP).
단백질의 2 차 구조 예측: ExPASy(Jpred 3)
다종 분자 시스템의 계통 발생 분석: EMBL(www. ebi. AC. uk/EMBL/)- 도구 상자 -Clustal2w
인간 아디포넥틴의 단백질 서열: NP_004788
인인슐린 성장인자 IB 의 전구체: P050 19