Flexner 대학을 졸업한 후, 나는 먼저 고향의 한 고등학교에서 가르쳤고, 후에 내가' 학자천국' 을 세우는 이상에 따라 학교를 설립했다. 학교를 운영하는 데 있어서 그는 학생의 주동성과 탐구정신을 중시하고, 학생들의 자기관리와 자기학습을 장려한다. 사람들은 이 학교를' 프레스너 씨의 학교' 라고 부른다.
1905 년, 그는 자신이 열심히 경영한 14 년 학교를 폐쇄하고 하버드 대학과 독일 대학에 대학원을 다녔다. 이 기간 동안 그는 고등 교육 연구에 대한 흥미를 유지했다. 그는 독일 고전 대학이 봉행하는' 대학은 과학 연구의 장소' 라는 이념을 광범위하게 흡수하여 유럽, 특히 베를린 대학의 학교 운영 방식에 깊은 인식을 가지고 있다.
65438-0909 년, 프레이크스나는 미국 카네기 교육 촉진 재단의 의뢰를 받아 당시 미국 의학 훈련에 대해 심도 있는 조사를 진행했다. 그는 대부분의 의대에서 의학 실험 교육이 전혀 없다는 것을 알게 되었고, 무책임한 증서상이었다. 조사 보고서에서 그는 의학 교육 개혁에 관한 몇 가지 중요한 건의를 제기했는데, 이러한 건의들은 나중에 대부분 정부에 의해 채택되어 미국에서 매우 효과적인 의학 교육 개혁 운동을 촉진시켰다. 이 운동에서 미국의 의학 훈련 기관 수준이 현저히 향상되었고 엄격한 의학 훈련 기준이 제정되었다.
그 후로 Flexner 는 록펠러 재단에 초청되어 중국에 베이징협화병원을 설립하는 것과 같은 다른 일을 하도록 초청되었다.