의료 폐수 처리에는 의료 폐기물 관리 규정의 관련 규정을 엄격히 집행해야 한다. 의료 하수 처리 제도는 병원이 하수 배출 시스템을 원활히 유지하고 병원 배출 시스템을 정기적으로 수리할 것을 요구한다. 직원들은 자신의 보호를 잘 하고, 오수를 채집할 때 장갑을 끼고, 조작 후 손을 씻는다. 하수의 총 잔류 염소를 하루에 두 번 감시하고 등록을 잘 한다.
또한 우리나라의' 의료폐기물 관리 규정' 에 따르면 의료보건기구가 생산하는 오수, 전염병 환자 또는 전염병 의심 환자의 배설물은 국가 규정에 따라 엄격하게 소독해야 한다. 국가가 규정한 배출 기준에 도달한 후에야 오수 처리 시스템으로 배출될 수 있다.
법은
"의료폐기물 관리조례" 제 20 조 의료위생기관에서 발생한 오수, 전염병 환자 또는 의심되는 전염병 환자의 배설물을 국가 규정에 따라 엄격하게 소독해야 한다. 국가가 규정한 배출 기준에 도달한 후에야 오수 처리 시스템으로 배출될 수 있다.